Kanker payudara merupakan tumor ganas pada jaringan payudara yang berasal dari tranformasi neoplastik epitel duktus ataupun lobulus payudara. Kanker payudara memiliki angka insidensi, tingkat mortalitas, dan tingkat mobiditas tertinggi di Indonesia. Mutasi pada gen PALB2 diprediksi dapat meningkatkan resiko terjadinya kanker payudara. Mutasi ini dapat berupa single nucleotide polymorphisms (SNPs) seperti halnya rs249954 dan rs180177102. Penelitian mengenai polimorfisme rs249954 dan rs180177102 gen PALB2 pada wanita penderita kanker payudara penting dilaksanakan karena berpotensi untuk menjadi biomarker bagi deteksi kanker payudara pada wanita. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme rs249954 dan rs180177102 gen PALB2 pada wanita pengidap kanker payudara di RSUD dr. Moewardi Surakarta. Selain itu, penelitian ini dilaksanakan untuk mengetahui frekuensi genotip CC, CT, dan TT dan frekuensi alel C dan T dalam polimorfisme gen PALB2 pada populasi sampel tersebut. Penelitian ini dilakukan secara deskriptif analitik pada gen PALB2 dengan metode PCR-RFLP dan sekuensing. Sampel yang digunakan berupa DNA yang diisolasi dari sampel darah whole blood. Subjek penelitian ini adalah wanita pengidap kanker payudara yang berobat di RSUD Dr. Moewardi Surakarta yang memenuhi kriteria inklusi dan bersedia ikut serta dalam penelitian. Penelitian akan dilaksanakan di Laboratorium Genetika dan Pemuliaan Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada serta Laboratorium Terpadu LPPT UGM selama 4 bulan, dari bulan Januari sampai dengan April 2023. Analisis data dilakukan dengan observasi pita hasil elektroforesis dan PCR-RFLP serta melalui komputerisasi dengan program Benchling dan SPSS. Hasil penelitian ini diharapkan dapat menyediakan suatu biomarker untuk prediksi dan diagnosis kanker payudara pada level genetik dan molekular.